Relatório de situação sobre diversidade genética do novo coronavírus SARS-CoV-2 em Portugal – 31-05-2021

31-05-2021

O Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge (INSA), através do Núcleo de Bioinformática do seu Departamento de Doenças Infeciosas, disponibiliza o mais recente relatório de situação sobre a diversidade genética do SARS-CoV-2 em Portugal. Até à data, foram analisadas 8.352 sequências do genoma do novo coronavírus, obtidas de amostras colhidas em mais de 100 laboratórios, hospitais e instituições, representando 278 concelhos de Portugal.

Desde o último relatório (05-05-2021), foram analisadas mais 1.027 sequências, incluindo 788 sequências obtidas no âmbito da vigilância de periodicidade mensal com amostragem nacional que o INSA está a coordenar, provenientes de laboratórios distribuídos por 18 distritos de Portugal continental e Região Autónoma dos Açores, abrangendo um total de 117 concelhos. A amostragem de maio cobriu 26% das amostras positivas reportadas durante o período em análise.

Entre as novas sequências analisadas, a variante 501Y.V1 (linhagem B.1.1.7), associada ao Reino Unido, foi detetada por sequenciação com uma frequência relativa de 87.7% na amostragem nacional de maio, continuando a ser a variante mais predominante em Portugal, enquanto que a variante 501Y.V2 (linhagem B.1.351), associada à África do Sul, foi detetada em 13 distritos e 42 concelhos, contudo a sua transmissão na comunidade tem sido limitada, uma vez que a sua frequência relativa se mantém relativamente baixa, tendo alterado de 1.3% em abril para 1.6% em maio.

Após a observação de um aumento considerável da frequência relativa da variante P.1 (501Y.V3, associada ao Brasil, Manaus) entre março (0.4%) e abril (4.3%), verificou-se uma ligeira diminuição em maio, tendo representado 2.8% dos casos analisados. Em relação à variante B.1.617.2 (associada à Índia), o mais recente relatório do INSA refere uma frequência relativa a nível nacional de 4.8%, com maior incidência nas regiões do Alentejo e Lisboa e Vale do Tejo, mas tendo sido já detetada em 9 distritos e 16 concelhos.

Desde abril de 2020, o INSA tem vindo a desenvolver o “Estudo da diversidade genética do novo coronavírus SARS-CoV-2 (COVID-19) em Portugal”, com o objetivo principal de determinar os perfis mutacionais do SARS-CoV-2 para identificação e monitorização de cadeias de transmissão do novo coronavírus, bem como identificação de novas introduções do vírus em Portugal.

Os resultados deste trabalho, que conta também com a colaboração de outros institutos parceiros no consórcio GenomePT, nomeadamente Instituto Gulbenkian de Ciência (IGC), Institute of Biomedicine (iBiMED, Univ. Aveiro), BioSystems & Integrative Sciences Institute (BioISI, Univ. Lisboa), Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos (CIBIO, Univ. Porto) e Instituto de Investigação e Inovação em Saúde (i3S, Univ. Porto), podem ser consultados aqui.

imagem do post do Relatório de situação sobre diversidade genética do novo coronavírus SARS-CoV-2 em Portugal – 31-05-2021