Relatório de situação sobre diversidade genética do novo coronavírus SARS-CoV-2 em Portugal – 08-11-2022

08-11-2022

O Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge (INSA), através do Núcleo de Genómica e Bioinformática do seu Departamento de Doenças Infeciosas, disponibiliza o mais recente relatório de situação sobre a diversidade genética do SARS-CoV-2 em Portugal. Até à data, foram analisadas 43.268 sequências do genoma do novo coronavírus, obtidas de amostras colhidas em mais de 100 laboratórios, hospitais e instituições, representando 307 concelhos de Portugal.

Segundo o relatório do INSA, a linhagem BA.5 da variante Omicron (incluindo as suas múltiplas sublinhagens) é dominante em Portugal desde a semana 19 (9 a 15 de maio), apresentando uma frequência relativa de 92,5% de acordo com a mais recente amostragem aleatória por sequenciação na semana 43 (24 a 30 de outubro). A linhagem BA.4 da variante Omicron representou 1,3% das sequências analisadas nas semanas 42 e 43, apresentando um decréscimo da sua frequência relativamente às semanas anteriores.

Por outro lado, a linhagem BA.2 da variante Omicron, dominante em Portugal entre as semanas 8 (21 a 27 de fevereiro) e 19 (9 a 15 de maio), apresenta desde então uma frequência relativa residual, apesar de um ligeiro aumento nas semanas 42 e 43, representando 6,9% das sequências deste período.

No decurso da monitorização contínua realizada pelo INSA, tem-se observado a emergência de sublinhagens de interesse, com novas constelações de mutações potencialmente associadas à resistência a anticorpos neutralizantes. Em Portugal, realça-se o aumento de frequência relativa das sublinhagens BF.7, BN.1 e BQ.1 e suas descendentes, em particular a BQ.1.1. Até à data, foram detetadas quatro sequências da sublinhagem recombinante XBB, a qual tem também aumentado de frequência em alguns países (p.ex., Singapura).

Desde abril de 2020, o INSA tem vindo a desenvolver o “Estudo da diversidade genética do novo coronavírus SARS-CoV-2 (COVID-19) em Portugal”, com o objetivo principal de determinar os perfis mutacionais do SARS-CoV-2 para identificação e monitorização de cadeias de transmissão do novo coronavírus, bem como identificação de novas introduções do vírus em Portugal. Atualmente, esta monitorização contínua assenta em amostragens semanais de amplitude nacional. Os resultados deste trabalho podem ser consultados aqui.